Den kulturellen Spurenund Nekropolen nach zu urteilen, langt Novaljas Geschichte noch in die Neolitzeit zurueck. Den Schriften nach, wird Novalja als erstes von Plinius dem aelterem erwaehnt und danach von Konstantin Porfirogenet im X. Jahrhundert. Als erstes wird der Ort Cissa genannt-die heutige Caska, und dan Kissa, damals die Hauptsiedlung auf der Insel, nach derren Hafen sie spaeter den Namen bekommen wird.

Die Stadt hat eine lange Geschichte von der die Ueberreste antischer Bauten zeugen, besonders die drei fruehkristlichen Basiliken aus dem 4 Jh. Ueberreste eines Mosaikes, aus einer der Basiliken, kann man in der Kirche der Heiligen Mutter Gottes von Ružarija im Zentrum der Stadt, sehen.Zahlreiche Objekte und Teile sakraler Objekte, werden in der arheologischen Sammlung Stomorica neben der Kirche, aufbewart.

Eine der groessten Atraktionen Novaljas ist der antische Aquaedukt, gebaut im 1 . Jh.v.C., in der Zeit des roemischen Reiches.